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急性附睾炎多由泌尿系感染沿输精管蔓延到附睾所致。经尿道器械操作、频繁导尿、前列腺摘除术后留置尿管等均是引起附睾炎的因素。急性附睾炎治疗不有效可转为慢性附睾炎。常见的致病菌以大肠杆菌多见，其次是变形杆菌、葡萄球菌、肠球菌及绿脓杆菌等，沙眼衣原体也可引起急性附睾炎。致病菌多经输精管逆行进入附睾。此外，细菌侵入附睾也可经淋巴管或经血行感染引起附睾炎，但少见。
由于射精管开口在前列腺窝，排尿时尿道压力可将尿液逆流进射精管。
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